Vanhalinnan tonttien jätehuolto on järjestetty keskitetysti siten, että alueelle rakennetaan jätteiden keräysalue, jossa on lukolliset keräyspisteet sekajätteelle, polttokelpoiselle jätteelle, kaatopaikkajätteelle, metallille, lasille ja paperille.

Kauppakirjan ehtojen mukaan tontin omistaja huolehtii oman rakentamisalueensa siisteydestä. Rakennusaikaisen jätteen vieminen keskitetyn keräysjärjestelmän keräyspisteisiin on ehdottomasti kielletty.

Turun Seudun Jätehuolto Oy hoitaa kaiken sopimuksiin liittyvän hallinnoinnin (sopimukset, avaimet, laskutuksen). Tontin omistaja tekee sopimuksen Turun Seudun Jätehuollon kanssa. Lopulliset jätehuoltopisteet otetaan käyttöön sitten kun käyttäjiä on riittävästi. Siihen saakka Turun Seudun Jätehuolto Oy järjestää jätehuollon väliaikaisin keräyspistein.